Berikut daftar kabupaten/kota di Provinsi Daerah Istimewa Yogyakarta beserta jumlah kecamatan dan kelurahan/desa:
- Kabupaten Bantul — 17 kecamatan, 75 desa/kelurahan
- Kabupaten Gunungkidul — 18 kecamatan, 144 desa/kelurahan
- Kabupaten Kulon Progo — 12 kecamatan, 88 desa/kelurahan
- Kabupaten Sleman — 17 kecamatan, 86 desa/kelurahan
- Kota Yogyakarta — 14 kecamatan, 45 kelurahan
Kota Yogyakarta
Kecamatan dan Kelurahan
1. Danurejan
- Bausasran
- Suryatmajan
- Tegal Panggung
2. Gedongtengen
- Pringgokusuman
- Sosromenduran
3. Gondokusuman
- Baciro
- Demangan
- Klitren
- Kotabaru
- Terban
4. Gondomanan
- Ngupasan
- Prawirodirjan
5. Jetis
- Bumijo
- Cokrodiningratan
- Gowongan
6. Kotagede
- Prenggan
- Purbayan
- Rejowinangun
7. Kraton
- Kadipaten
- Panembahan
- Patehan
8. Mantrijeron
- Gedongkiwo
- Mantrijeron
- Suryodiningratan
9. Mergangsan
- Brontokusuman
- Keparakan
- Wirogunan
10. Ngampilan
- Ngampilan
- Notoprajan
11. Pakualaman
- Gunungketur
- Purwokinanti
12. Tegalrejo
- Bener
- Karangwaru
- Kricak
- Tegalrejo
13. Umbulharjo
- Giwangan
- Muja Muju
- Pandeyan
- Semaki
- Sorosutan
- Tahunan
- Warungboto
14. Wirobrajan
- Pakuncen
- Patangpuluhan
- Wirobrajan
Kabupaten Bantul
Kecamatan
- Bambanglipuro
- Banguntapan
- Bantul
- Dlingo
- Imogiri
- Jetis
- Kasihan
- Kretek
- Pajangan
- Pandak
- Piyungan
- Pleret
- Pundong
- Sanden
- Sedayu
- Sewon
- Srandakan
Kabupaten Sleman
Kecamatan
- Berbah
- Cangkringan
- Depok
- Gamping
- Godean
- Kalasan
- Minggir
- Mlati
- Moyudan
- Ngaglik
- Ngemplak
- Pakem
- Prambanan
- Seyegan
- Sleman
- Tempel
- Turi
Kabupaten Gunungkidul
Kecamatan
- Gedangsari
- Girisubo
- Karangmojo
- Ngawen
- Nglipar
- Paliyan
- Panggang
- Patuk
- Playen
- Ponjong
- Purwosari
- Rongkop
- Saptosari
- Semin
- Semanu
- Tepus
- Tanjungsari
- Wonosari
Kabupaten Kulon Progo
Kecamatan
- Galur
- Girimulyo
- Kalibawang
- Kokap
- Lendah
- Nanggulan
- Panjatan
- Pengasih
- Samigaluh
- Sentolo
- Temon
- Wates